集团公司下设八个部室，综合办公室、党委工作部、财务审计部、项目技术部、生产加工部、收储物流部、市场营销部、协会管理部。

集团公司践行传承创新中医药文化，推进健康中国建设发展战略，全面构建规模化、标准化、高效化的中医药大健康全产业链，业务覆盖中药材种子种苗繁育推广；中药材生产加工销售；药酒、药茶、药膳等药食同源大健康产品的研发；中药材电子商务，中医药养生文化旅游相关服务；药品批发；药品生产；药品零售。特别是中药材原料药、中药饮片以及中药大健康产品三大板块上优势明显，拥有“晋卉堂”“晋药堂”“喝摩本草”等注册商标和“喝摩本草局”大健康专营店。

在省供销社党组“稳字当头、干在实处”总方针指引下，山西省中药材集团以中药农业为基础，中药工业为主体，中药商业为枢纽，中药创新为驱动力，金融与保险为融通保障，全面推进全产业链布局；积极扩大中药材集团品牌影响力，持续提升企业为农服务综合实力，助力乡村振兴，发挥行业引领带动作用，不断夯基求变、迈向高端，为实现中医药强省作出更大贡献。